皇帝菊本身就很会分枝，所以管理上不必刻意摘心，但如果不打算收种子的话，就要将残花剪除。如果皇帝菊生长过高或盛花过后，如果想修剪的话，建议采用齐头式的方法，也就将全部的枝叶剪去1/3，同时补充肥料;这样做有助于重新生长和开花，而且同时也能矮化植株。
生长期管理
①施肥管理：黄帝菊移植后5-10天，开始追肥，一般选用氮、磷、钾为2：1：1的肥料(通常是复合肥十尿素)以及叶面肥，在l周内轮流喷施一次。随苗的生长，浓度逐渐从800倍增加到500倍。黄帝菊的分枝能力很强，一般不用打顶。
②水分管理：黄帝菊生长迅速，对肥水的要求较高，白天尽早浇水，特别是7—9月天气非常炎热，浇水最好在上午10点前浇透土壤，下午如果部分土壤干燥，最好补浇一次水份。
③病害防治：黄帝菊在高温高湿的天气下易发生病害，如炭疽病和枯萎病。
炭疽病表现为叶片上病斑近圆形，湿度大时，病斑呈深褐色湿润状，干燥时，中央裂开成穿孔状。防治方法：
A.铲除田间杂草，减少病原。
B.增施有机肥，降低氮肥施用量。
C.在田间初见发病应立即施药，用70%甲基托布津可湿性粉剂50克，加75%的百菌清可湿性粉剂100克兑水60升，或用50%多菌灵可湿性粉剂500倍，40%灭病威300—400倍喷施，隔7天1次，连续2—3次。
枯萎病表现为被害植株底叶或植株一侧叶片边缘变黄，后萎蔫，最后整株枯死，防治方法：
A.种植前土壤消毒处理。
B.定植后用50%多菌灵可湿性粉剂1500倍或25%多菌灵可湿性粉剂750倍液作定根水灌根。
C.发病后敌克松1000倍液淋透土壤。
开花期管理
开花前期，适当调节氮、磷、钾比例，将其比例改为l：l：l，同时配施促进开花的叶面肥、磷酸二氢钾和其它微量元素肥料。黄帝菊的开花特性是连续不断的，在南方，该品种除冬天外，其它时间都可开花。
